Клуб создан под наименованием «Строитель» в 1985 году.
В 1989 году «Строитель» занимает второе место в Первенстве СССР по мини-футболу, в 1995 году в г. Гродно (Белоруссия) на Международном турнире по мини-футболу, где принимали участие команды из Польши, Белоруссии, Украины, рудненская команда «Строитель» занимает I место.
В 1999 году на I Чемпионате Республики Казахстан по мини-футболу среди команд суперлиги рудненские футзалисты завоевывают золотые медали, став первыми чемпионами Казахстана.
В этом же году рудненские футболисты Баймуратов Талгат, Глебов Артем, Ильюхин Сергей и Клинов Игорь играют в составе сборной Казахстана. Сборная на чемпионате Азии (Малайзия) впервые становится бронзовым призёром, а в 2000 году — серебряным призёром (Таиланд).
В сезоне 2001-02 завоевывают бронзовые медали чемпионата. Следующий сезон для клуба становится крайне неудачным. Клуб проигрывают 17 матчей из 19-ти.
В 2007 году создается МФК «Аят». В 2007 году по итогам Первенства РК по футзалу среди команд первой лиги, в котором приняли участие 6 команд со всей Республики команда «Аят» занимает первое место и получает путёвку в высший дивизион. В этом же году рудненская команда в турнире на приз Президента Футбольного Союза Казахстана по футзалу занимает первое место.
В 2008 году участие в Х Чемпионате РК по футзалу среди команд высшей лиги сезона 2007—2008 гг. 5-е место.
В 2009 году на 11 Чемпионате РК по футзалу сезона 2008/2009 гг. команда «Аят» заняла 4 место, отставая всего на 2 очка от третьего места. Два игрока команды вошли в состав сборной РК по футзалу Григорий Шамро, Асхат Альжаксин. Старовойтов Сергей став членом молодёжной сборной Казахстана по футзалу, участвовал в финальном турнире Европейских стран молодёжных сборных, проходящего в городе Санкт-Петербург. В этом же сезоне была создана молодёжная команда «Аят-дубль», которая показала хорошее выступление в Чемпионате Костанайской области по мини-футболу заняв 1 место.
В 2010 году впервые в истории клуба «Аят», став третьим в розыгрыше XV Кубка по футзалу, продолжил «Бронзовую» серию и в XIII Чемпионате Республики Казахстан по футзалу среди команд высшей лиги. Александр Метелкин легионер из России играющий в составе «Аят» признан лучшим бомбардиром Кубка и Чемпионата РК. Пять игроков клуба вошли в состав национальной сборной Казахстана по футзалу: Григорий Шамро, Николай Казаков, Тимур Мурзабаев, Данияр Кенжегулов, Александр Якименко.
Город Рудный является родоначальником футзала Казахстана. МФК «Аят» – первый чемпион, многократный серебряный и бронзовый призёр Чемпионата Республики Казахстан по футзалу. Тренировочный процесс проходит на базе «Аят футзал арены», соответствующей всем европейским стандартам качества.
В 2019 году, из 54 стран Европы, команда «Аят» завоевала путевку в основной раунд Лиги Чемпионов УЕФА и дошла до элитного раунда, попав в 16 лучших команд и достойно заняла 7 строчку рейтинга команд – участниц Лиги Чемпионов УЕФА.
В сезоне 2021/2022, став финалистом Чемпионата Республики Казахстан, МФК «Аят» вновь становится участником Лиги Чемпионов УЕФА и занимает 8 строчку рейтинга команд.
В сезоне 2022/2023 став финалистом Чемпионата Республики Казахстан, команда МФК «Аят» также становится участником Лиги Чемпионов УЕФА. Многие воспитанники МФК «Аят» неоднократно вызывались в состав Сборной Казахстана по футзалу.
В сезоне 2024/2025 годов в состав Сборной Казахстана, неоднократно, были вызваны воспитанники команды МФК «Аят» — Азат Валиуллин, Ерсултан Сагындыков, Рауан Сисенгалиев, а также ассистентом главного тренера Сборной стал воспитанник МФК «Аят» — Смолин Василий Алексеевич.
Достижения МФК «Аят» в Чемпионате РК по футзалу:
1 «Аят» Чемпион ЧРК 1998/1999
2 «Аят» Серебряный призер ЧРК 2015/2016
3 «Аят» Серебряный призер ЧРК 2016/2017
4 «Аят» Серебряный призер ЧРК 2018/2019
5 «Аят» Серебряный призер ЧРК 2021/2022
6 «Аят» Серебряный призер ЧРК 2022/2023
7 «Аят» Бронзовый призер ЧРК 2000/2001
8 «Аят» Бронзовый призер ЧРК 2010/2011
9 «Аят» Бронзовый призер ЧРК 2013/2014
10 «Аят» Бронзовый призер ЧРК 2014/2015
11 «Аят» Бронзовый призер ЧРК 2017/2018
12 «Аят» Бронзовый призер ЧРК 2020/2021
13 «Аят» Бронзовый призер ЧРК 2023/2024
